在囊泡介导的蛋白质运输到溶酶体区室中发挥作用，包括内吞膜转运和自噬途径。据信，作为推定的 HOPS 内体系留复合物的核心成分，被认为部分参与 Rab5 到 Rab7 内体的转化，可能与 MON1A/B 有关，并通过结合 SNARE 和 SNARE 复合物介导 SNARE 介导的膜融合过程中的系留和对接事件。建议将 HOPS 复合物募集到晚期内体膜上的 Rab7 中，并调节向溶酶体的晚期内吞、吞噬和自噬运输 （PubMed：23351085）。参与晚期内体之间的同型囊泡融合以及晚期内体与溶酶体之间的异型融合，这与内吞产物降解有关（PubMed：9159129、PubMed：23167963、PubMed：25445562、PubMed：25908847）。自噬体与溶酶体融合所必需的 （PubMed：25783203）。可能通过与 RILP 的结合将 HOPS 复合物与内体 Rab7 连接起来，并通过与 ARL8B 的结合与溶酶体膜连接，这表明这些相互作用可能使隔室接近融合 （PubMed：25445562， PubMed：25908847）。参与独立于 HOPS 的直接反式高尔基体到溶酶体膜蛋白晚期内体转运 （PubMed：23322049）。参与对受调节分泌通路的分选，可能与 AP-3 接头复合物有关。可能在受调节分泌通路中发挥 HOPS 非依赖性功能 （PubMed：24210660）。