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分子可视化软件（PyMol，VMD）的安装方法—上篇

分子动力学模拟最终结果的本质就是众多原子的一个动态轨迹，想通过计算轨迹的数据，将其可视化成我们想要的蛋白形状，就会用到可视化软件。蛋白可视化软件有很多，以下是一些常用的：

软件	说明
PyMOL	功能强大，支持多种蛋白可视化方式，包括球棒模型、线框模型等
VMD	主要用于大分子的可视化，可以显示蛋白质、核酸、膜、溶剂等。
Chimera	支持多种文件格式，可以进行蛋白质和核酸等大分子的可视化。
Discovery Studio	功能强大，可以进行蛋白质、核酸、小分子等大分子的可视化和分析。
RasMol	用于分子可视化的经典软件之一，可以对蛋白质和核酸进行可视化。
Jmol	基于Java的分子可视化程序，可以在网页上进行蛋白质和核酸的可视化。