背景
核苷修饰体外转录mRNA是疫苗、蛋白替代以及再生医学的核心技术。目前常用修饰核苷酸如假尿苷、5-甲基胞嘧啶虽能大幅降低TLR、RIG-I的天然免疫识别,但仍存在难以突破的疗效短板:修饰mRNA进入细胞后仍触发I型干扰素应答,IFN-β持续分泌重塑胞内RNA代谢微环境,大幅加速外源mRNA降解,致使蛋白表达峰值低、持续时间短。另外,针对慢性肺病、缺血修复等需多次给药的疾病,重复递送会逐级放大天然免疫应答,mRNA半衰期持续缩短,治疗效果不断下滑。
迄今针对临床广泛使用的修饰mRNA,其胞内降解细胞器、核心核酸酶以及完整信号轴缺失系统论证,缺少可体内应用的通用增效手段,而现有小分子IFN通路抑制剂存在全身免疫抑制风险,难以长期给药。针对这一空白,近日广州医科大学研究团队在Nature Communications杂志发表重要工作,团队完整拆解了修饰mRNA降解的分子通路,并开发两种可与治疗性mRNA共递送的稳定化策略,为下一代mRNA药物优化提供全新分子靶点与递送方案。
本文所用关键修饰核苷酸4-Thio-UTP(B7978)、Pseudo-UTP(B7972)、5-Methyl-CTP(B7967)以及Cy5-UTP(B8333)由APExBIO提供。

期刊 Nature Communications
IF值 18.1
DOI 10.1038/s41467-026-72025-3
关键实验数据
研究构建14种宿主、病毒来源免疫抑制因子文库,在多类细胞完成高通量筛选,SOCS1、冠状病毒M蛋白脱颖而出,数据显示SOCS1和M蛋白在12、24、48h全时间点提升荧光报告基因表达,最高可达6倍。在原代巨噬、气道上皮、肝细胞、COPD患者原代支气管细胞均有效,而经典免疫抑制蛋白NS1、B18R仅局限少数细胞起效。

在3D人肝和肺类器官体系中,SOCS1分别使mCherry表达提升15倍和5倍,证实该策略在更贴近人体组织三维环境同样高效。重复转染实验极具临床参考价值:单纯mRNA二次给药后半衰期骤降至1.7h,而SOCS1共递送可恢复至21.1h,彻底解决多次给药疗效衰减核心瓶颈。

首先RNA-seq基因覆盖分析直观展示mRNA的5'端降解被SOCS/M几乎完全阻断,表明先天免疫抑制剂能保护IVT mRNA免受5'至3'方向的降解。

Cy5荧光标记mRNA与P小体标志物DCP1a共定位实验证实,IFN刺激大幅提升P小体数量与体积,而使用SOCS/M处理后P小体数量体积显著减少。使用环己酰亚胺(CHX)(P小体组装抑制剂)干扰P小体形成,可使IVT mRNA的降解降低。综合数据表明,SOCS1和M蛋白通过抑制P小体形成以及IVT mRNA的P小体整合,有效阻止5'-3'降解过程,从而延长mRNA的半衰期。

通过创新4SURNAMS交联质谱技术捕获全部mRNA结合蛋白,锁定XRN1为降解关键执行酶。细胞敲低以及体内siRNA递送双重验证显示,XRN1缺失后mRNA稳定性大幅提升,表明IVT mRNA在P小体中通过XRN1介导发生降解,而该过程可被M/SOCS1蛋白抑制。

最后搭建三类典型mRNA治疗动物模型,用于完整评估SOCS1的体内增效能力。SP-B先天性肺缺陷模型中,SP-B mRNA联合SOCS多次气道给药,显著缓解肺泡出血、肺纤维化,病理切片胶原沉积面积大幅下降;Matrigel血管生成模型,ETV2转录因子mRNA联合SOCS,体内新生血管数量显著增多;后肢缺血修复模型,SDF-1α促血管生成mRNA搭配SOCS,显著加速肢体血流恢复,缺血区域毛细血管密度提升近2倍,综合展现出稳定剂与mRNA联用的强大治疗潜力。

小结
本研究首次揭示IFN-β-P小体-XRN1是修饰IVT-mRNA特异性降解核心级联通路,明确P小体为降解微区,XRN1为关键执行核酸酶,填补修饰mRNA降解机制领域空白,并筛选获得宿主SOCS1、冠状病毒M两种广谱mRNA稳定剂,二者通过阻断IFN信号抑制P小体形成与XRN1募集,显著延长mRNA半衰期,解决单次给药表达低、重复给药疗效衰退两大瓶颈。
该工作不仅改了修饰mRNA胞内代谢基础认知,为mRNA药物序列优化、递送佐剂开发提供全新分子靶点,也为解释炎症环境下内源mRNA稳态失衡提供全新理论框架,拓展炎症、纤维化疾病的基础研究思路。




沪公网安备 31011002003500