背景
近年来,mRNA技术在疫苗、癌症治疗、再生医学等领域展现出巨大潜力。尤其是新冠疫苗的成功,证明了mRNA递送系统(如脂质纳米颗粒LNP)的安全性和有效性。但如何将mRNA精准递送到特定器官,以实现基因和蛋白替代治疗的最大化,是当前mRNA药物开发的核心难题。
目前LNP主要实现了对肝脏的高效递送,而肝外器官(如肺、脾、骨髓、胎盘等)的选择性递送仍面临巨大挑战。传统方法如调节LNP表面电荷(SORT策略)、修饰脂质化学结构,虽然取得一定进展,但设计空间有限,且存在副作用(如肺靶向LNP诱发血栓等)。
近日,清华大学研究团队在Nature Materials杂志发表的题为Peptide codes for organ-selective mRNA delivery的研究论文,本研究提出一种全新的肽编码器官选择性递送(POST, Peptide-encoded Organ-Selective Targeting)策略,通过在LNP表面修饰特定氨基酸序列,实现对肝、肺、脾等多器官的精准递送。文内所用于验证POST靶向功能的FLuc mRNA、定制化Itgav/Itgb3 mRNA均由APExBIO提供。
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【期刊】Nature Materials
【IF值】38.5
【DOI】10.1038/s41563-025-02331-6
(文末阅读原文)
核心创新与发现
肽是天然“可编程”的生物聚合物,氨基酸序列决定其多种功能。研究团队首先将不同长度(3、6、8等)和类型(R、K、D、E、H、T等)的亲水性氨基酸肽段,通过巯基-马来酰亚胺点击化学与DSPE-PEG脂质偶联,形成肽修饰的LNP。通过微流控混合,与MC3、胆固醇、DSPC等共同自组装制备出18种肽修饰LNP(POST-LNP)。通过将修饰不同肽码的LNP包裹荧光素酶mRNA,静脉注射小鼠,检测各器官表达。结果表明3R-LNP(3个精氨酸)能够实现肝脏特异性递送,6R-LNP(6个精氨酸)能够靶向肺部,而6D-LNP(6个天冬氨酸)则能特异靶向脾脏。

进一步的研究发现这种递送效果对肽段长度和氨基酸类型高度敏感,仅单个氨基酸的变化即可切换靶向器官,比如通过去除6R-LNP中的三个R基团,即可将肺部靶向功能转换为肝脏靶向(3R-LNP)(图1c)。而如果对6R-LNP进行定点突变,将末端的精氨酸(R)替换为组氨酸(H),则其肺部选择性完全消失(图1e-h)。综合表明,通过模块化调整肽段序列,能够精确调控LNP的器官靶向性。

图1 通过肽编码调节器官选择性和递送效率
LNP进入体内后,表面吸附血浆蛋白形成“蛋白冠”,决定其器官归巢趋势。为阐明POST编码的器官靶向机制,团队对POST-LNPs的蛋白质冠层进行分析。蛋白质组学分析发现不同肽码修饰的LNP在血浆中形成了特异性蛋白冠,如6R-LNP富集了肺靶向相关的Vtn(Vitronectin)蛋白(图2 e),而Vtn的受体αvβ3整合素在肺部高表达。分子动力学模拟揭示6R肽与Vtn的结合力、刚性、能量释放率在6个R时达到最优,解释了肺靶向的分子力学基础(图2h-m)。体内外实验进一步证实,Vtn蛋白冠通过与肺部高表达的αvβ3整合素受体结合,促进了LNP在肺部的选择性摄取。总之,POST编码通过其冠状蛋白特征实现器官选择性靶向,这些蛋白特征源于肽序列依赖的肽-蛋白亲和力的相互作用。

图2 POST-LNP选择器官的机制
为了让肽码的设计更加智能化及理性,研究团队开发出基于Transformer的蛋白语言模型,结合AlphaFold 3结构预测和MD模拟,实现了肽码与Vtn蛋白高亲和力的AI辅助设计。如模型给出新设计的RRRYRR肽码在体内外均表现出比6R更强的肺靶向能力,展示了AI数字化、可预测的递送策略,为未来大规模、高通量的递送系统开发提供新范式。

图3 AI理性设计编码肽,指导肺靶向LNP合成
最后团队从普适性的角度出发,验证了POST平台不仅用于多种临床相关的离子化脂质(如SM-102、ALC-0315、LP01)和不同磷脂(DSPC、DOPC、DOPE、HSPC),均能保持器官选择性,而且除mRNA外,POST-LNP还可递送反义寡核苷酸(ASO)等多类型核酸,实现肝、肺、脾的特异性基因沉默。通过调整肽码和配方,POST-LNP可实现胎盘、骨髓、脂肪组织、睾丸等多种器官的选择性递送,具备强大的器官靶向扩展性能。并兼容多重常规基因编辑工具如Cre重组酶mRNA、CRISPR/Cas9系统,完成肝、肺、脾等器官的特异性基因编辑,在功能细胞(如肺泡上皮细胞、脾B/T细胞等)中也能实现有效递送,具备广阔的转化应用前景。

图4 POST可作为普遍适用的递送平台
小结
本研究以“肽码”为核心,开创了器官选择性mRNA递送的全新平台,不仅为mRNA疗法的临床转化提供了强有力的技术支撑,也为纳米药物递送、精准医学、AI驱动的生物材料设计等领域带来了深远影响。未来,随着POST平台与高通量筛选、AI算法的结合,“数字化、可编程的体内递送”有望成为现实,推动基因与蛋白替代疗法迈向更广阔的应用前景。

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