众所周知,当我们的身体遭遇严重感染时,免疫系统的中性粒细胞会作为第一道防线,释放出网状的中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)来捕获病原体。然而,过量的免疫反应反而会损伤自身组织,加剧脓毒症的恶化。
近期,武汉大学宋学敏教授团队在《Advanced Science》发表的“Acod1 Promotes PAD4 Ubiquitination via UBR5 Alkylation to Modulate NETosis and Exert Protective Effects in Sepsis”研究。

【期刊】Advanced Science
【IF值】14.1
【DOI】10.1002/advs.202411652
APExBIO有幸为该文章提供转录组和非靶代谢组的技术服务。
01
脓毒症患者体内的“异常信号”
研究之初,团队观察到一个关键现象:临床脓毒症患者和盲肠结扎穿孔(CLP)小鼠模型的外周血中,NETs特征成分水平显著升高(图一C、D),且与Acod1的基因表达密切相关。通过转录组和代谢组分析发现,脓毒症状态下,中性粒细胞中Acod1的表达量大幅上升(图一A),其代谢产物衣康酸(ITA)的水平也同步升高(图一B)。更有趣的是,Acod1的mRNA水平与NETs标志物呈显著负相关(图一E、F),且与脓毒症严重程度(SOFA评分、APACHE II评分)同样负相关(图一G、H)——这暗示Acod1可能是抑制NETs过度形成的“保护因子”。

图一
02
基因敲除实验:Acod1缺失加剧脓毒症
为验证Acod1的作用,团队构建了Acod1基因敲除小鼠模型,并诱导脓毒症。结果令人震惊:敲除Acod1的小鼠7天存活率显著下降,肺、肝、肾等器官损伤更严重(图二A),外周血中促炎因子(TNF-α、IL-6)水平大幅上升(图二B),加剧炎症、器官损伤并降低生存率(图二C)。各项数据充分证明Acod1缺失会加剧脓毒症进程。

图二
03
机制探索:Acod1通过衣康酸调控NETs
Acod1是如何发挥作用的?其实Acod1可以催化乌头酸脱羧,产生衣康酸(ITA),且已有研究表明Acod1蛋白的H159、L272、H277位点是直接参与ITA生产的活性功能表位。所以作者将野生型和一系列Acod1突变质粒转染到Acod1敲除细胞中,结果发现H159、L272、H277突变体(不产生ITA)导入后,此时NETs水平依旧不受抑制;而能过量产生ITA的N152S突变体,则能显著降低NETs(图三A、B)。体外实验进一步证实,外源性添加ITA或其衍生物4-OI,能浓度依赖性地抑制LPS诱导的NETs生成,其中10mM ITA可使NETs标志物减少50%以上(图三C、D)。这些结果明确了:Acod1并非直接作用,而是通过生成ITA来调控NETs形成。

图三
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核心机制:UBE5介导的PAD4降解通路
已经证明,Acod1通过生成ITA来调控NETs形成,但是又是如何调节的呢?NETs形成的核心步骤是PAD4酶催化组蛋白瓜氨酸化。团队发现,Acod1/ITA并不影响PAD4的转录,而是加速其蛋白降解(图四A-F),而泛素-蛋白酶体系统(UPS)和自噬是细胞内蛋白质降解的主要途径。通过 cycloheximide(CHX)追踪实验,证实Acod1过表达使PAD4的半衰期从24小时缩短至9小时(图四G),且这一过程可被蛋白酶体抑制剂MG132阻断(图四H)。

图四
进一步研究发现,这是由于Acod1/ITA促进了PAD4的K48型多泛素化——这种修饰会引导蛋白质进入蛋白酶体降解途径。谁是这场“降解大戏”的关键执行者?蛋白质组学分析揭示,E3泛素连接酶UBR5与PAD4存在相互作用(图五A),CoIP实验显示UBR5主要结合PAD4的C端结构域(aa523-663)(图五B)。当UBR5被敲低后,Acod1诱导的PAD4降解被完全阻断(图五C),NETs水平回升(图五D)——这证明UBR5是Acod1/ITA调控通路的关键中介,Acod1/ITA以UBR5依赖性方式促进PAD4降解,从而调节NET的形成。

图五
05
分子点睛:衣康酸的“烷基化修饰”
最令人惊叹的发现在于ITA的作用方式:作为一种亲电分子,ITA通过迈克尔加成反应对UBR5的半胱氨酸2768(Cys2768)进行烷基化修饰,显著增强其E3泛素连接酶活性。团队通过点突变实验验证,当Cys2768被突变为丝氨酸后,UBR5无法被ITA修饰,PAD4的泛素化水平下降60%,NETs抑制效应完全消失。Acod1/ITA通过烷化Cys2768位点增强UBR5酶活性,进而促进K48连接的泛素化和PAD4的降解,从而调节NETs。

图六
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研究意义:从基础到临床的桥梁
这项研究层层递进,从临床现象出发,通过基因敲除、代谢干预、分子互作等实验,最终揭示了“Acod1/ITA→UBR5烷基化→PAD4泛素化降解→NETs抑制”的完整通路。这不仅为脓毒症的免疫代谢调控提供了全新视角,更提示Acod1、UBR5或可作为潜在治疗靶点。未来,通过调控这一通路,有望在清除病原体的同时避免自身损伤,为脓毒症患者带来新的治疗希望。



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