2025年1月,首都儿科研究所的袁静教授团队在Cell Reports Medicine(IF=14.3)上发表了题为"High-alcohol-producing Klebsiella pneumoniae aggravates lung injury by affecting neutrophils and the airway epithelium"的研究文章。该研究揭示了高酒精代谢肺炎克雷伯菌(HiAlc Kpn)通过影响中性粒细胞和气道上皮细胞,导致中性粒细胞凋亡并诱导肺纤维化和活性氧(ROS)的产生,加重肺损伤的机制。
APExBIO荣幸地为该项研究提供了非靶代谢组学检测服务,帮助揭示了HiAlc Kpn感染后肺组织中的代谢物变化。
文章链接:https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101886
图1
1.研究背景
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae, Kpn)是一种常见的病原体,主要定植于上呼吸道和肠道。过量酒精摄入会减少多形核中性粒细胞的生成和细菌清除,并影响肺泡巨噬细胞的功能,进而导致肺损伤和宿主抗炎能力的降低。
近年来,研究发现某些Kpn菌株能够通过2,3-丁二醇发酵途径产生高浓度的内源性酒精,进而引发内源性酒精性脂肪肝等疾病。本文希望发现内源性酒精产生与HiAlc Kpn引起的肺损伤之间是否存在联系,并深入研究HiAlc Kpn在酒精代谢影响肺损伤、肺炎发病机制中的具体作用。
2.研究思路
本研究首先从临床肺炎患者的呼吸道样本中分离出多个Kpn菌株,检测其酒精产生能力并以此能力分类,同时区分其不同的基因型及耐药性(图2)。
图2
随后,通过建立持续感染肺炎克雷伯菌的小鼠模型,研究HiAlc Kpn在肺损伤中的作用机制,重点关注其对中性粒细胞和气道上皮细胞的影响。研究团队通过基因组、单细胞转录组、非靶代谢组、蛋白芯片、ELISA、WB、免疫组化、TUNEL测定、及多种菌株酒精/酶活/中性粒细胞/Seahorse检测等方法,揭示了HiAlc Kpn通过酒精代谢影响中性粒细胞的吞噬功能,并导致肺氧化损伤的分子机制。
3.研究结果
3.1 HiAlc Kpn在临床肺炎患者中的普遍性及酒精生产能力
研究团队从肺炎患者的痰液和支气管肺泡灌洗液(BALF)中分离出68株Kpn菌株,发现其中91.2%的菌株能够产生过量的乙醇。根据酒精生产能力,这些菌株被分为高酒精生产型(HiAlc Kpn)、中酒精生产型(MedAlc Kpn)和低酒精生产型(LowAlc Kpn)。进一步分析发现,HiAlc Kpn菌株的毒力显著高于LowAlc Kpn菌株,且HiAlc Kpn感染患者的血液中性粒细胞数量显著降低(图3)。
图3
3.2 HiAlc Kpn在小鼠肺损伤模型中的酒精产生情况
为了验证HiAlc Kpn在体内的酒精代谢能力,研究团队利用CRISPR-Cas9系统敲除了HiAlc Kpn菌株中的酒精脱氢酶基因(adh),发现敲除后的菌株酒精生产能力显著降低(图4,A-C)。
随后,通过建立小鼠急性肺损伤(HDAI)和慢性肺纤维化(LDPI)模型,根据模型间滴注HiAlc Kpn的代谢物成分对比,结合上调的核心物质磷酸酶D(一种催化乙醇转化为PE的蛋白),研究团队发现HiAlc Kpn菌株能够在肺组织中产生乙醇,并通过非氧化代谢途径生成磷脂酰乙醇胺(PE),进一步证实了HiAlc Kpn在肺组织中的酒精代谢能力(图4,D-J)。


图4
3.3 HiAlc Kpn通过驱动中性粒细胞G0和G1亚型在急性肺损伤中的作用
通过急性肺损伤模型及噬菌体处理组的对比,研究发现HiAlc Kpn通过调节中性粒细胞亚型的募集和功能,显著影响了肺部的免疫反应和病理变化。
HiAlc Kpn感染后,肺部的中性粒细胞被分为两个主要亚型:G0和G1。G0亚型主要表达与颗粒相关的基因(如IHTn、Saa3、Prdx1、Cd63和Corl2),并表现出较高的颗粒特异性基因表达水平。这些细胞在感染早期被大量募集到肺部,参与对病原体的早期免疫反应;G1亚型则表现出与炎症反应和吞噬功能相关的基因表达(如Iftm6、Lrg1、Ngp、Iftm1和Retnlg),并在感染后期发挥重要作用(图5)。![640[1].png](https://resource.apexbio.cn/content_center/4/20250311/640[1].png)
图5
通过单细胞RNA测序和发育轨迹分析,发现G0亚型在感染早期占主导地位,而G1亚型则在感染后期逐渐增多。表明乙醇的产生可能抑制了G1亚型的吞噬功能(图6,A-C)。此外,HiAlc Kpn通过抑制嘧啶代谢相关基因(如Aicda、Cidador 1和Upp1)的表达,使得G1亚型的中性粒细胞凋亡,削弱了宿主的免疫清除能力(图6,I-J)。

图6
研究结果表明,HiAlc Kpn通过调节中性粒细胞亚型的募集和功能,影响了肺部的免疫反应,并加剧了肺损伤。乙醇的产生不仅抑制了中性粒细胞的吞噬功能,还通过诱导细胞凋亡和氧化应激,进一步加重了肺部的病理损伤(图6J、6K)。
3.4 HiAlc Kpn诱导的肺纤维化和氧化损伤
在慢性肺损伤模型中,HiAlc Kpn感染导致小鼠肺组织中出现明显的纤维化病变,并伴有氧化损伤,主要表现为中性粒细胞、巨噬细胞和成纤维细胞的浸润、肺重量、羟脯氨酸浓度、BALF细胞数、纤维化因子IL-1α和IL-1β的升高(图7,A-E)。
通过转录组分析,研究团队发现HiAlc Kpn感染后,肺组织中的氧化应激相关代谢通路显著富集。同时,HiAlc Kpn感染还导致肺组织中过氧化氢(H2O2)浓度升高,而过氧化物酶/过氧化氢酶活性降低,由此确认了HiAlc Kpn与肺组织损伤的关联:HiAlc Kpn通过产生内源性乙醇和活性氧(ROS)导致氧化损伤,抑制抗氧化基因如Gpx4和Nrf2的表达(图7I, 6J)。


图7
总结
本研究揭示了高酒精代谢肺炎克雷伯菌(HiAlc Kpn)通过其酒精代谢能力,影响中性粒细胞和气道上皮细胞,进而加重肺损伤的分子机制。研究团队通过多组学及各类详细的分子生物学及病理研究,发现HiAlc Kpn的酒精产生能力与呼吸道疾病的严重程度密切相关:其通过抑制嘧啶代谢导致中性粒细胞凋亡,并通过氧化代谢产生ROS,导致肺氧化损伤。这些发现为HiAlc Kpn相关肺炎的治疗提供了新的思路和潜在靶点。
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