解困 — 显著降低宿主污染,深度探究微生态
2024-11-21 09:40:11
在宏基因组研究的深入探索中,我们聚焦于微生物与宿主间复杂的相互作用,这一领域已成为人类及动植物科学研究的重中之重。然而,我们在实际研究中遭遇了一个不容忽视的问题:宿主污染。特别是在肿瘤组织、皮肤、血液、乳液、肺泡灌洗液及口鼻拭子等样本中,宿主污染的比例往往居高不下。
尽管宏基因组技术为我们提供了强大的检测手段,但在某些情况下,实验结果中的测序数据竟有高达90%以上来源于宿主基因组,这极大地削弱了微生态研究的有效性和准确性。面对这一挑战,传统的宏基因组测序方法显得捉襟见肘,难以对这些受污染样本中的微生物群落进行精确分析。研究者们深知这一问题的严重性,并期待通过不断的技术革新和方法改进,克服这一障碍,更深入地揭示微生物与宿主之间的奥秘。
APExBIO整合自身技术优势,结合多篇高分文献,开发出解决这一难题的宿主核酸耗竭技术,为高质量的MAGs组装和宏基因组学研究提供了可行办法。
优势
1、高效去除宿主基因组污染
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2、大幅提升宏基因组数据使用率、MAGs组装完整度
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3、获取更多的MAGs,以及准确的MAGs物种注释
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方法
自研前处理方法+试剂盒A
适用样本类型:全血、肺泡灌洗液、痰液、脑脊液、新鲜咽、鼻、口腔等拭子采集液(宿主细胞≤1X107个)
特点:该技术试剂盒中的Buffer SL选择性地将宿主细胞裂解,释放的宿主核酸被Ultra Nuclease核酸酶迅速降解,而细菌、真菌等微生物在此过程中几乎无损失。
费用:提取+200/样
测序数据量:建议10G起
结果展示
「有效去除宿主核酸」
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「显著提高微生物检出数」
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总结
上述技术适用于高宿主污染的样本进行宏基因组测序,提高数据结果的灵敏度和准确性,有助于关注样本中微生物的老师更全面、更深层次的研究微生物群落。



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