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简介

宏基因组研究以环境中所有微生物基因组为研究对象,通过对环境样品中的全基因组DNA进行高通量测序,获得单个样品的饱和数据量,基于denovo组装进行微生物群落结构多样性,微生物群体基因组成及功能,特定环境相关的代谢通路等分析,从而进一步发掘和研究具有应用价值的基因及环境中微生物群落内部、微生物与环境间的相互关系。构建的环境微生物基因集,可为环境中微生物的研究、开发和利用提供基因资源库。

人肠道宏基因组调查以人肠道meta基因组的整合基因集(Integrated Gene Catalog, IGC)作为参考数据集,并整理对应的物种、功能数据库;可方便快速获得针对人肠道微生物的特异性研究结果,包括:人肠道微生物基因、物种和功能信息,寻找组间差异marker,构建样本分类器等。

技术优势

研究内容多样;可组装单菌;样本类型广泛;经验丰富;取样建议有针对性;样本需求量低;个性化分析,有专门团队负责,提供切实可行的项目方案,兼顾商业合作、科研合作优势;售前、售后服务,提供结题报告解读,及其他个性后售后服务。

实验流程

生信分析

基于测序数据的基础分析和个性化分析,提供详细的分析结题报告。

送样建议

环境样本:土壤5-10g,污泥/沉积物5-10g,水体-滤膜过滤至有可见覆盖物,粪便3-5g,血液10mL。

DNA:总量≥ 1μg,浓度≥10ng/μL,OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解,无污染。

送样管务必标清样品编号,管口使用封口膜密封。

样品保存期间切忌反复冻融,送样时使用干冰运输。

地址:上海市杨浦区国权北路1688号湾谷科技园A8栋701室