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Cyanine dyes

Cyanine染料是在具有离域电荷的两个氮原子之间含有聚甲炔桥的分子,多年来在生命科学领域一直被用作染料试剂。cyanine_dyes在20世纪90年代早期,自从Cy3,Cy5和Cy7作为琥珀酰亚胺酯商业出售,cyanine染料开始广泛地用于核酸标记。由于它们具有大的消光系数和良好的量子产率,因此荧光明亮,并且它们还具有低的非特异结合生物分子的性质,所以Cy染料被广泛用于DNA和RNA标记。根据水溶性的不同,cyanine染料可以分为两类:非磺化cyanine和磺化cyanine。

非磺化cyanines
可用的非磺化染料包括Cy3,Cy3.5,Cy5,Cy5.5,Cy7和Cy7.5。Cy代表“cyanine”,第一个数字表示假吲哚之间的碳原子数。加上后缀.5的是苯并稠合的cyanine。除酰肼和胺的盐酸盐外,大多数非磺化cyanine衍生物具有低的水溶性。它们可溶于有机共溶剂(5-20%的DMF或DMSO)。当这些分子用于生物分子标记时,首先将其溶于有机溶剂中,并加入到含有生物分子(蛋白质,肽,氨基标记的DNA)的适当水溶液中。非磺化cyanine的荧光性质对溶剂和反应环境的依赖较小。

磺化cyanines
可用的磺化cyanine包括sulfo-Cy3,sulfo-Cy5和sulfo-Cy7,其具有额外的磺基官能团,有助于染料分子在水中的溶解。带电的磺酸基减少了染料分子和重标记共轭物的聚集。磺化cyanine是高水溶性的,它们不需要使用有机共溶剂就可以在水环境中进行标记。

应用


磺化和非磺化cyanine表现出非常相似的荧光性质。然而,非磺化cyanine在使用前必须溶于有机共溶剂(DMF或DMSO)中,并加入到含有目标分子的水性缓冲液中。对于Cy3,Cy5,Cy7,共溶剂的推荐体积为10%,对于后缀.5的对应物,推荐体积为15%。磺化cyanine试剂可在纯水环境下使用。cyanine的纯化也有差异:当使用水或水性缓冲液透析纯化时,必须使用sulfo-Cy以有效去除未反应的染料。可以通过凝胶过滤,色谱(HPLC,FPLC,离子交换)或电泳来纯化磺化和非磺化cyanine的反应。

非磺化cyanine可用于多种物质的标记,包括:
• 可耐受有机共溶剂的可溶性蛋白质。
• 抗体(使用5-10%的DMSO/DMF)。
• DNA和寡核苷酸。
• 多肽。
• 多种小分子。
• 有机介质中的反应(二氯甲烷,乙腈)。
磺化cyanine也可用于多种物质的标记,包括:
• 可耐受有机共溶剂的可溶性蛋白质。
• 抗体(使用5-10%的DMSO/DMF)。
• DNA和寡核苷酸。
• 多肽。
• 多种小分子。
• 遇DMF或DMSO变性的敏感蛋白质。
• 通过透析纯化的蛋白质偶联物。
• 水溶液中的纳米颗粒。
• 不溶性或疏水性蛋白质。

生化试剂

  1. 产品编号 产品名称 信息
  2. A8100 Cy3 NHS ester (non-sulfonated) 氨基反应性荧光染料,不溶于水
  3. A8101 Cy3.5 NHS ester (non-sulfonated) 氨基反应性荧光染料,不溶于水
  4. A8102 Cy5 NHS ester (non-sulfonated) 氨基反应性荧光染料,不溶于水
  5. A8103 Cy5.5 NHS ester (non-sulfonated) 氨基反应性荧光染料,不溶于水
  6. A8104 Cy7 NHS ester (non-sulfonated) 氨基反应性荧光染料,不溶于水
  7. A8105 Cy7.5 NHS ester (non-sulfonated) 氨基反应性荧光染料,不溶于水
  8. A8107 Cy3 NHS ester 氨基反应性荧光染料,溶于水
  9. A8108 Cy5 NHS ester 氨基反应性荧光染料,溶于水
  10. A8109 Cy7 NHS ester 氨基反应性荧光染料,溶于水
  11. A8111 Cy3 azide (non-sulfonated) 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  12. A8112 Cy3.5 azide (non-sulfonated) 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  13. A8113 Cy5 azide (non-sulfonated) 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  14. A8114 Cy5.5 azide (non-sulfonated) 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  15. A8115 Cy7 azide (non-sulfonated) 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  16. A8116 Cy7.5 azide (non-sulfonated) 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  17. A8127 Cy3 azide 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  18. A8128 Cy5 azide 用于点击化学,标记炔烃修饰的寡核苷酸
  19. A8130 Cy3 alkyne (non-sulfonated) 用于点击化学,标记任何带有叠氮基的分子
  20. A8131 Cy5 alkyne (non-sulfonated) 用于点击化学,标记任何带有叠氮基的分子
  21. A8132 Cy3 carboxylic acid (non-sulfonated) 非反应性荧光团,用于对照实验和校准
  22. A8133 Cy5 carboxylic acid (non-sulfonated) 非反应性荧光团,用于对照实验和校准
  23. A8134 Cy5.5 carboxylic acid (non-sulfonated) 非反应性荧光团,用于对照实验和校准
  24. A8135 Cy7 carboxylic acid (non-sulfonated) 非反应性荧光团,用于对照实验和校准
  25. A8136 Cy7.5 carboxylic acid (non-sulfonated) 非反应性荧光团,用于对照实验和校准
  26. A8137 Cy5 carboxylic acid 非反应性荧光团,用于对照实验和校准
  27. A8138 Cy3 maleimide (non-sulfonated) 巯基反应性荧光染料,不溶于水
  28. A8264 Cy3.5 maleimide (non-sulfonated) 巯基反应性荧光染料,不溶于水
  29. A8139 Cy5 maleimide (non-sulfonated) 巯基反应性荧光染料,不溶于水
  30. A8140 Cy5.5 maleimide (non-sulfonated) 巯基反应性荧光染料,不溶于水
  31. A8141 Cy7 maleimide (non-sulfonated) 巯基反应性荧光染料,不溶于水
  32. A8142 Cy7.5 maleimide(non-sulfonated) 巯基反应性荧光染料,不溶于水
  33. A8143 Cy5 amine (non-sulfonated) 可以与NHS酯,羧基(碳二亚胺活化后)和环氧化物等反应性基团反应
  34. A8144 Cy5 Boc-hydrazide (non-sulfonated) 羰基反应性荧光染料,不溶于水
  35. A8145 Cy5 hydrazide (non-sulfonated) 羰基反应性荧光染料,不溶于水
  36. A8261 Cy5.5 hydrazide (non-sulfonated) 羰基反应性荧光染料,不溶于水
  37. A8265 Cy3 hydrazide (non-sulfonated) 羰基反应性荧光染料,不溶于水
  38. A8266 Cy3.5 hydrazide (non-sulfonated) 羰基反应性荧光染料,不溶于水

参考文献

1.Flors C. DNA and chromatin imaging with super-resolution fluorescence microscopy based on single-molecule localization. Biopolymers. 2011 May;95(5):290-7.

2.Kricka LJ. Stains, labels and detection strategies for nucleic acids assays. Ann Clin Biochem. 2002 Mar;39(Pt 2):114-29.

3.Swatton JE, Prabakaran S, Karp NA, Lilley KS, Bahn S. Protein profiling of human postmortem brain using 2-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis (2-D DIGE). Mol Psychiatry. 2004 Feb;9(2):128-43.

4.Kettenhofen NJ, Wang X, Gladwin MT, Hogg N. In-gel detection of S-nitrosated proteins using fluorescence methods. Methods Enzymol. 2008;441:53-71.